Biodigestores são sistemas anaeróbios para tratamento de efluentes, sendo sua utilização bastante difundida no meio rural, sobretudo como alternativa para o tratamento de efluentes da produção de animais na agropecuária.
A utilização dos biodigestores gera ganhos ambientais ao reduzir a carga poluidora dos efluentes, mas também pode gerar ganhos econômicos com a produção do biogás e dos compostos orgânicos para adubação.
Existem alguns modelos de biodigestor, a aplicabilidade de cada um irá depender de fatores como área disponível para implantação, volume de efluente gerado, periodicidade de geração de efluentes.